Prof. Dr. Stefan Wiemann

Fellow-Klasse 2012-13

Forschungsgebiete:

Systematische Analysen von Genomen und Transkriptomen, zunächst bei der ersten Sequenzierung eines eukaryotischen Genoms (S.cerevisiae), dann mit der Identifizierung, funktionellen Charakterisierung und Aufdeckung von Krankheitsassoziationen humaner Gene. Der gegenwärtige Focus liegt auf der Untersuchung molekularer Mechanismen in der Entstehung und Progression von Brustkrebs sowie in der Durchführung von Hochdurchsatz-Sequenzierungen, z.B. im ICGC.
 

Curriculum Vitae

Arbeitsvorhaben

Ausgewählte Publikationen:

• Uhlmann S, Zhang JD, Schwager A, Mannsperger H, Riazalhosseini Y, Burmester S, Ward A, Korf U, Wiemann S, Sahin O: miR-200bc/429 cluster targets PLCgamma1 and differentially regulates proliferation and EGF-driven invasion than miR-200a/141 in breast cancer. Oncogene 2010, 29:4297-4306.
• Temple G, Gerhard DS, Rasooly R, Feingold EA, Good PJ, Robinson C, Mandich A, Derge JG, Lewis J, Shoaf D, et al: The completion of the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res 2009, 19:2324-2333.
• Taylor CF, Field D, Sansone SA, Aerts J, Apweiler R, Ashburner M, Ball CA, Binz PA, Bogue M, Booth T, et al: Promoting coherent minimum reporting guidelines for biological and biomedical investigations: the MIBBI project. Nat Biotechnol 2008, 26:889-896.
• Mathivanan S, Ahmed M, Ahn NG, Alexandre H, Amanchy R, Andrews PC, Bader JS, Balgley BM, Bantscheff M, Bennett KL, et al: Human Proteinpedia enables sharing of human protein data. Nat Biotechnol 2008, 26:164-167.
• Sahin O, Löbke C, Korf U, Appelhans H, Sultmann H, Poustka A, Wiemann S, Arlt D: Combinatorial RNAi strategy: The next generation of quantitative protein network analysis. Proc Natl Acad Sci U S A 2007, 104:6579-6584.
• Neubrand VE, Will RD, Möbius W, Poustka A, Wiemann S, Schu P, Dotti CG, Pepperkok R, Simpson JC: Gamma-BAR, a novel AP-1 interacting protein involved in post-Golgi trafficking. EMBO J 2005, 24:1122-1133.
• Wiemann S, Arlt DH, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, et al: From ORFeome to biology: a functional genomics pipeline. Genome Res 2004, 14:2136-2144.
• Smahi A, Courtois G, Vabres P, Yamaoka S, Heuertz S, Munnich A, Israel A, Heiss NS, Klauck SM, Kioschis P, et al: Genomic rearrangement in NEMO impairs NF-kappaB activation and is a cause of incontinentia pigmenti. Nature 2000, 405:466-472.
• Heiss NS, Knight SW, Vulliamy TJ, Klauck SM, Wiemann S, Mason PJ, Poustka A, Dokal I: X-linked dyskeratosis congenita is caused by mutations in a highly conserved gene with putative nucleolar functions [see comments]. Nat Genet 1998, 19:32-38.
• Dujon B, Albermann K, Aldea M, Alexandraki D, Ansorge W, Arino J, Benes V, Bohn C, Bolotin-Fukuhara M, Bordonne R, et al: The nucleotide sequence of Saccharomyces cerevisiae chromosome XV. Nature 1997, 387:98-102.